- ‘Introducción al análisis estadístico de los estudios de asociación de genoma completo (GWAS)’ se desarrollará en el CRAI-TIC entre el 14 y el 17 de julio
- El curso permitirá a los participantes aprender a realizar análisis de datos genómicos a gran escala y a completar meta-análisis de estudios de asociación de genoma completo, entre otros
Con el título ‘Introducción al análisis estadístico de los estudios de asociación de genoma completo (GWAS)’, la Universidad de León abordará en un curso de verano esta herramienta de investigación genética que analiza el ADN de un gran número de individuos o animales para identificar variaciones genéticas. Tendrá lugar, en modalidad presencial, entre el 14 y el 17 de julio en el aula de formación SCAYLE en el Edificio CRAI-TIC y está dirigido por el catedrático de la Facultad de Veterinaria, Juan José Arranz Santos y por la responsable administrativa y de formación del Centro de Supercomputación Castilla y León (SCAYLE), Ruth Alonso Martínez.
El curso pretende introducir los conceptos básicos implicados en la selección de diseños experimentales y la adaptación de modelos estadísticos para la realización de Estudios de Asociación de Genoma Completo (GWAS) y abordará también aspectos básicos de los análisis funcionales post-GWAS.
Además, se pretende contextualizar a los alumnos en relación a posibles herramientas (plataformas de genotipado, software, bases de datos, etc.) que puedan ser de utilidad específica o más adecuadas para estudios que tengan como centro del estudio animales de interés agrario.
El curso tendrá una duración total de 36 horas (equivalentes a 1,7 créditos ECTS) y está dirigido a estudiantes de postgrado en Ciencias de la Vida, así como a investigadores que quieren iniciarse en los análisis genéticos de asociación.
Al finalizar con éxito este curso, los participantes serán capaces de realizar control de calidad, imputación y análisis de datos genómicos a gran escala mediante enfoques estadísticos y herramientas de software estándar; completar meta-análisis de estudios de asociación de genoma completo y análisis de variantes raras; evaluar críticamente los resultados de los análisis de asociación y visualizarlos de manera adecuada y, finalmente, comprender el diseño y los hallazgos de estudios publicados en revistas científicas revisadas por pares.
Además del director Juan José Arranz Santos, el curso contará con los ponentes y profesores Cristina Esteban Blanco, de la Fundación Centro de Supercomputación de Castilla y León, investigadora postdoctoral de Gastrointestinal Genetics Lab, CICbioGUNE y Pablo Augusto de Souza Fonseca, científico titular del Instituto de Ganadería de Montaña (CSIC-ULE).
EL PROGRAMA
14 de julio: Introducción y Herramientas Computacionales, ponente Cristina Esteban Blanco
- 09:00 – 11:00: Introducción al entorno Linux
- 11:00 – 11:20: Pausa
- 11:20 – 14:00: Introducción al entorno Linux y R (si hiciera falta)
- 15:30 – 18:30: Uso de Caléndula para la gestión de datos genómicos (Clase 1)
15 de julio: Fundamentos y Modelos Estadísticos
- 09:00 – 11:00: Conceptos de genética de poblaciones y estudios de asociación genética, ponente Juan José Arranz Santos
- 11:00 – 11:20: Pausa
- 11:20 – 14:00: Fundamentos teóricos sobre GWAS y análisis estadísticos, ponente Cristina Esteban Blanco
- 15:30 – 18:30: Plataformas de genotipado, control de calidad e imputación, ponentes Cristina Esteban Blanco y Pablo Augusto de Souza Fonseca
16 de julio: Análisis de asociación y Prácticas GWAS, ponente Pablo Augusto de Souza Fonseca
- 09:00 – 11:00: Análisis de asociación y estructura de poblaciones
- 11:00 – 11:20: Pausa
- 11:20 – 14:00: Imputación
- 15:30 – 18:30: Práctica de GWAS
17 de julio: Análisis Post-GWAS, ponente Pablo Augusto de Souza Fonseca
- 09:00 – 11:00: Análisis post-GWAS (Meta-análisis) – Identificación de candidatos funcionales y mapeo fino
- 11:00 – 11:20: Pausa
- 11:20 – 14:00: Práctica de análisis post-GWAS
LEÓN 24 HORAS
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